Bienvenue dans la newsletter de décembre 2024 !

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Notez que le secrétariat de l'AMMNet sera en congé annuel du 23 décembre au 2 janvier. Si vous avez une demande, notre réponse sera retardée pendant cette période, mais nous vous répondrons dès que possible.

AMMnet vous souhaite de joyeuses fêtes de fin d'année !

Inscrivez-vous au séminaire mensuel de l'AMMNet
7 janvier 2025, 15 h UTC

Leçons tirées de l'organisation et de l'accueil d'événements régionaux

Présentation par les lauréats d'un petit événement

Présentateurs :

  • Brésil : Olawale Awe, SAlly — Laboratoire d'apprentissage statistique de l'Université fédérale de Bahia
  • Bénin : Keller Alphonse Konkon, CREC : Centre de recherche entomologique de Cotonou
  • Nigéria : Ezra Gayawan, Département des statistiques, Université fédérale
    de la technologie
  • Thaïlande : Sompob Saralamba, Unité de recherche en médecine tropicale Mahidol d'Oxford

Inscrivez-vous au séminaire du 7 janvier ici

Le programme d'enrichissement du corps professoral de modélisation appliquée du paludisme accepte les candidatures !

Le programme d'enrichissement du corps professoral (FE) est une initiative innovante conçue pour doter les professeurs d'Afrique subsaharienne des compétences nécessaires à la modélisation opérationnelle du paludisme, renforçant ainsi les capacités locales pour une lutte antipaludique fondée sur des preuves. Ce programme en présentiel de 8 semaines met l'accent sur les compétences techniques, la communication scientifique et le renforcement de la communauté, en ciblant les professeurs qui peuvent maintenir et diffuser les compétences au sein de leurs institutions. Le programme comprend une formation appliquée au cours de laquelle les participants choisissent une voie pour relever les défis de santé publique par le biais de projets. Il met l'accent sur le développement des compétences en matière de modélisation, d'interprétation des données et de communication. Les opportunités de mise en réseau sont fournies par le biais de plateformes mondiales telles que AMMNet, favorisant la collaboration. En outre, des commentaires et des évaluations réguliers par des évaluateurs indépendants du programme sont mis en œuvre pour améliorer continuellement le programme. Ce programme comble les lacunes en matière d'expertise locale en ciblant les professeurs qui peuvent influencer les générations futures de modélisateurs et travailler en étroite collaboration avec les programmes de lutte contre le paludisme. Il associe une formation technique avancée à des applications pratiques pour soutenir un effort de modélisation durable et localisé du paludisme.

Consultez les dépliants et les liens du programme en anglais et en français ci-dessous pour les dates limites, les informations relatives aux demandes et les détails de candidature.

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Envoyez un e-mail pour toute demande ici

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Prix AMMNet pour les petits événements

17 candidatures ont été reçues de membres du Kenya, du Bénin, d'Éthiopie, du Cameroun, du Ghana, du Libéria, du Nigeria, de Tanzanie et du Rwanda !

Le groupe de travail chargé de l'examen a commencé à examiner les candidatures et vise à sélectionner environ 5 lauréats pour un financement. Attendez-vous à une annonce contenant des détails sur le lauréat qui sera publiée en janvier 2025.

Soumettez votre candidature avant la prochaine date limite de soumission des Small Event Awards, le 1er mars 2025

  • Rappel des exigences: Les candidats doivent soumettre le modèle disponible sur notre site Web en cliquant sur le lien ci-dessous au lieu d'un document de proposition

Plus d'informations et de conseils ici

Le prochain hackathon virtuel AMMNet : Cartographie en R

Les détails seront bientôt disponibles !

Vous pouvez trouver les enregistrements et le matériel de tous les hackathons organisés précédemment sur notre blog.

  • Visualisation des données dans R
  • Data Wrangling dans R

Retrouvez le blog de l'AMMNet Hackathon ici

ERSILIA a besoin de votre avis !

Ersilia est une organisation à but non lucratif qui développe l'open source Outils d'IA pour la recherche sur les maladies infectieuses. Ils entreprennent un projet d'envergure pour s'assurer qu'ils répondent aux besoins réels de la communauté des chercheurs, et votre contribution est essentielle. Répondez à leur rapide sondage en suivant le lien ci-dessous.

Répondez à l'enquête ici

Rejoignez le groupe WhatsApp d'AMMNet

Rejoignez le groupe WhatsApp d'AMMnet et communiquez directement avec les membres, recevez des annonces, notamment des offres d'emploi, des financements, des opportunités de collaboration et des informations sur les événements à venir.

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Offres d'emploi et opportunités de subventions

Dix postes de bourses de recherche appliquée disponibles aux Centers for Disease Control and Prevention (CDC)

Le CDC a créé un programme d'analyse et de modélisation d'une durée de deux ans dans le cadre de la bourse Steven M. Teutsch sur l'efficacité de la prévention du CDC afin de se concentrer sur l'application de la modélisation mathématique, des prévisions et des analyses avancées en santé publique.

La bourse PE recrute environ 10 boursiers en modélisation en 2025. Les candidats doivent être titulaires d'un doctorat dans un domaine mathématique ou analytique tel que la modélisation mathématique, la recherche opérationnelle, l'écologie, l'épidémiologie quantitative ou un autre domaine des sciences appliquées. Les boursiers sont jumelés à des programmes du CDC et se concentrent sur des travaux liés à la transmission de maladies, aux modèles individuels, compartimentaux et basés sur des agents, à l'espace, aux réseaux, à la simulation, à la dynamique des systèmes ou aux modèles économétriques. Une formation sera dispensée dans les domaines de l'analyse des décisions, de la modélisation de la transmission des maladies, de l'économétrie avancée, de l'apprentissage automatique et de l'analyse des mégadonnées, de la visualisation des données et des applications logicielles clés telles que R, Julia, Python, etc.

Toutes les exigences en matière de doctorat doivent être remplies avant le 18/07/2025. Le salaire annuel de départ est d'environ 98 000$ plus les avantages sociaux fédéraux. La bourse commence le 8/11/2025 avec un programme d'orientation et de formation intensif. Personnes intéressées postulez en ligne sur le lien ci-dessous entre le 9/3/2024 et le 1/3/2025.

Veuillez adresser vos questions à : Coordinateur du programme de bourses PE, 404-861-3882 ou PEF@cdc.gov.

Date limite de soumission : 1/3/25

Postulez en ligne pour les postes du CDC ici

Poste de professeur en épidémiologie des maladies infectieuses disponible à l'Université de Wageningen

Rejoignez l'Université et la recherche de Wageningen en tant que membre du corps professoral (assistant, associé, professeur titulaire) en épidémiologie des maladies infectieuses ! Nous recherchons un universitaire passionné pour mener des recherches innovantes sur les maladies animales et zoonotiques, encadrer des doctorants et contribuer à des projets percutants à l'interface entre le bétail, la faune et l'homme. Si vous êtes prêt à faire avancer votre carrière et à faire une différence dans le domaine de la santé vétérinaire et publique, explorez cette opportunité passionnante dès aujourd'hui ! C'est toi que nous cherchons.

Le groupe d'épidémiologie des maladies infectieuses (IDE) de l'université et de la recherche de Wageningen recherche un chercheur universitaire ambitieux et enthousiaste, spécialisé dans la modélisation mathématique basée sur les données, en mettant l'accent sur les maladies animales ou zoonotiques. Des ensembles de compétences tels que l'épidémiologie spatiale, la modélisation intra-hôte, l'inférence bayésienne et les approches phylodynamiques présentent un intérêt particulier pour le groupe, tout comme l'accent mis sur le changement global.

En tant que candidat retenu, vous rejoindrez le cadre de carrière universitaire et progresserez dans le parcours des professeurs (professeur adjoint, associé ou titulaire).

Vos devoirs et responsabilités incluent :

  • Mener des recherches scientifiques en épidémiologie des maladies infectieuses
  • Recherche active de financement pour créer et maintenir votre propre ligne de recherche
  • Mentorat de stagiaires
  • Contribuer aux cours de l'IDE
  • S'engager activement dans l'équipe de l'IDE pour favoriser un environnement universitaire stimulant pour tous.

Vos recherches seront intégrées à la chaire Epidémiologie des maladies infectieuses (IDE), dirigée par le professeur Quirine ten Bosch.

Pour en savoir plus sur le poste et postuler, cliquez ici

Poste de chercheur postdoctoral disponible à l'UC Berkeley

Le département de démographie de l'Université de Californie à Berkeley lance un appel à candidatures pour un poste de chercheur postdoctoral au sein du groupe de recherche de la professeure Ayesha Mahmud. Ce poste fait partie d'un nouveau projet financé par le NIH intitulé « Nouvelles données et approches pour la modélisation dynamique du comportement humain et de l'écologie des maladies infectieuses ». Le candidat retenu travaillera sur plusieurs études visant à comprendre comment le comportement humain et la dynamique démographique interagissent avec le changement climatique pour influencer la propagation et l'évolution des maladies infectieuses.

Les candidatures seront examinées sur une base continue et seront accepté jusqu'au 15 février.

Pour en savoir plus sur le poste et postuler, cliquez ici

Associé postdoctoral en applications climatiques aux maladies à transmission vectorielle

L'Institut coopératif de recherche en sciences de l'environnement (CIRES) de l'Université du Colorado à Boulder (CU Boulder) encourage les candidatures pour un associé post-doctoral en applications climatiques aux maladies à transmission vectorielle à Boulder, au Colorado.

Pour en savoir plus et postuler, cliquez ici

Poste d'associé de recherche postdoctoral disponible à l'Université de Californie du Sud

Le Dr Ajitesh Srivastava, du département de génie électrique et informatique de l'Université de Californie du Sud, recherche un associé de recherche postdoctoral pour travailler avec lui sur l'intersection de la modélisation des épidémies et de l'apprentissage automatique. Le candidat contribuera au développement de la prévision, de la projection, de la compréhension et de l'évaluation des maladies infectieuses, ainsi qu'à de nouvelles méthodes d'apprentissage en profondeur. Le candidat aura l'occasion de présenter ses travaux à des experts en épidémiologie et en santé publique et de créer des systèmes qui aident à répondre aux questions de politique de santé publique.
Il s'agit d'un poste à durée déterminée d'un an avec possibilité de renouvellement. Les candidatures seront examinées immédiatement et se poursuivront jusqu'à ce que le poste soit pourvu. Les candidats intéressés doivent envoyer les documents suivants à ajiteshs@usc.edu : (1) un CV académique, (2) un énoncé de recherche (1 à 2 pages) résumant les travaux antérieurs pertinents et les orientations de recherche proposées. N'hésitez pas à contacter le Dr Srivastava pour de plus amples informations.

Envoyez un e-mail ici pour toute demande ou pour postuler

Professeur assistant/associé/titulaire de science des données et de biostatistique

Poste disponible à l'Université de Harvard

Le département de science des données du Dana-Farber Cancer Institute (DFCI) et le département de biostatistique de la Harvard T.H. Chan School of Public Health (HSPH) recherchent des candidats pour occuper un poste de professeur menant à la permanence au niveau assistant, associé ou titulaire.

En savoir plus et postuler ici pour le poste de professeur de biostatistiqueEn savoir plus et postuler ici pour le poste de professeur adjoint de biostatistique et de science des donnéesLisez plus et postulez ici pour le poste de professeur assistant/associé/titulaire de science des données et de biostatistique

Sous-groupes, groupes de travail et activités régionales

Directives pour la création d'une section locale de l'AMMNet

Les sections locales de l'AMMNet réunissent des modélisateurs, des analystes, des scientifiques, des professionnels de la santé publique, des institutions partenaires et la société civile, pour travailler ensemble au niveau local afin d'adopter des approches communes afin d'améliorer l'utilisation de la modélisation et de l'analyse pour contrôler et éliminer le paludisme, tout en reflétant la mission de Global AMMNet.

La création d'une section locale de l'AMMNet est un processus en trois étapes :

  • Pré-enregistrement auprès du réseau mondial AMMNet
  • Un formulaire de demande d'établissement d'une section locale dûment rempli
  • Approbation du Conseil d'administration de l'AMMNet avec les conseils du groupe de travail chargé de la révision des chapitres locaux

Si vous êtes membre de l'AMMNet et que vous souhaitez créer une section locale, veuillez consulter les informations et les directives disponibles sur le lien ci-dessous.

Si vous avez des questions, des considérations ou des suggestions concernant la création de sections locales de l'AMMnet, veuillez nous envoyer un e-mail à info@ammnet.org.

Informations et conseils sur les sections locales

Récapitulation et enregistrements du séminaire

Événement spécial AMMNet :

27 novembre 2024
Webinaire sur les outils Medicines for Malaria Venture (MMV)

Le séminaire a comporté trois présentations :

1) Stephen Brand, Présentation de MMVSola, un outil pharmacométrique de découverte pour la prédiction de la pharmacocinétique humaine et de la dose d'antipaludéen. Cette présentation a décrit une nouvelle application pharmacométrique en libre accès appelée MMvSola, comment elle estime la pharmacocinétique humaine et la dose d'antipaludéens expérimentaux et comment l'outil est utilisé par les équipes de découverte.

2) Jérémy Besnard et Benoît Laleu, Développement d'un outil de conception de médicaments en libre accès. Cette présentation s'est concentrée sur la manière dont Medicines for Malaria Venture (MMV) entend créer un outil de conception de médicaments en libre accès qui utilise des méthodes d'apprentissage automatique (ML) pour aider les scientifiques travaillant dans le domaine de la santé mondiale, y compris, mais sans s'y limiter, le paludisme et les maladies tropicales négligées (MTN). Cet outil impliquera la modélisation des données, la conception générative, le filtrage (utilisant les propriétés, le métabolisme des médicaments, les modèles prédictifs de sécurité), la prédiction par synthèse et la sélection de cibles synthétiques sur la base d'un apprentissage actif.

3) Gemma Turon, The Ersilia Model Hub : modèles open source AI/ML pour la recherche sur le paludisme dans les pays du Sud. La présentation finale portait sur l'initiative Ersilia Open Source. Ersilia est une organisation à but non lucratif axée sur la recherche qui vise à équiper les laboratoires des pays à faible revenu d'outils d'intelligence artificielle (IA) pour la recherche sur les maladies infectieuses. Ils ont décrit leur approche informatique et leur infrastructure, en se concentrant sur la manière dont leurs outils d'IA/ML ont fait avancer la découverte de médicaments antipaludiques dans des environnements aux ressources limitées et contribuent à un monde plus égalitaire de la recherche biomédicale.

Série de séminaires AMMNet :

3 décembre 2024
Formation de modélisateurs du paludisme en Afrique subsaharienne : expériences du programme d'enrichissement du corps professoral (FE)

Conférencier : Dr. Mor Absa LOUM et Dr. Isaiah Awintuen Agorinya

Lors de ce séminaire, deux conférenciers ont parlé de leur expérience dans le cadre du programme d'enrichissement du corps professoral, dans le cadre duquel ils ont formé des modélisateurs du paludisme d'Afrique subsaharienne. Le programme d'enrichissement du corps professoral (FE) est une initiative innovante conçue pour doter les professeurs d'Afrique subsaharienne des compétences nécessaires à la modélisation opérationnelle du paludisme, renforçant ainsi les capacités locales pour une lutte antipaludique fondée sur des preuves.

Dr Isaiah Awintuen Agorinya, maître de conférences à l'Université de la santé et des sciences connexes du Ghana, spécialisé en épidémiologie, biostatistique et modélisation des maladies infectieuses. Au cours du séminaire, il a partagé son expérience du programme mené au Ghana. Le programme de 18 semaines vise à constituer une masse critique de chercheurs en modélisation capables de former la prochaine génération de modélisateurs. Les participants suivent un programme complet couvrant la modélisation mathématique appliquée, la communication scientifique et l'établissement de liens. Le programme comprend des activités structurées, telles que des tutoriels, des clubs de lecture et un apprentissage par projet, avec des étapes pour l'élaboration d'objectifs spécifiques, des présentations orales et des biosketches du NIH. Les défis techniques tels que le calcul à haute performance et le financement ont été soulignés, ainsi que les deux composantes du programme : le renforcement des compétences techniques et la communication scientifique. Les évaluations effectuées au niveau de référence, de milieu et de fin garantissent une amélioration continue. Le Dr Isaiah a souligné les avantages de l'organisation du programme en Afrique, tels que la rentabilité et la réduction des problèmes de visa, tout en reconnaissant les obstacles tels que la connectivité Internet et l'accès aux ressources informatiques.

Le Dr Mor Absa LOUM, maître de conférences et chercheur à l'université Iba Der Thiam de Thiès, au Sénégal, spécialisé dans la biostatistique et la modélisation des maladies infectieuses, a discuté de la mise en œuvre du programme au Sénégal, qui a été adapté aux participants francophones. Il a décrit en détail l'historique du programme et son expansion pour tenir compte de la diversité linguistique. Des défis sont apparus lors de la formation de 2023, qui s'est déroulée entièrement en anglais, ce qui a entraîné des difficultés pour certains participants francophones. La formation FE de 2024 au Sénégal a abordé ces questions en intégrant l'enseignement en français pour améliorer l'accessibilité. Le Dr Absalon a souligné l'importance de la collaboration entre la Northwestern University, le WCAD et les institutions locales dans la mise en œuvre du programme. Il a également souligné que la familiarité culturelle et la réduction des obstacles liés à l'obtention de visas constituaient des avantages liés à l'organisation de la formation en Afrique, tout en réitérant les défis logistiques et techniques rencontrés lors de la mise en œuvre.

Vous pouvez trouver un enregistrement de ces séminaires sur notre site web ou YouTube ainsi que des enregistrements d'autres événements spéciaux et séminaires antérieurs.

Des enregistrements en français, anglais et portugais sont disponibles.

Enregistrements des séminaires sur le site Web

Résumé de la réunion du Conseil

Le Conseil s'est réuni le 10 décembre 2024

Présents : Antonio, Nadège, Justin, Jaline, Cherlynn, Hannah, Caitlin, Émilie
Absents : Emmanuel (participe à un atelier et ne pourra peut-être pas y assister), Luc est en voyage et ne pourra probablement pas y assister, Susan
Secrétariat présent : Shannon, Ida

Création de sections locales

  • Recommandations pour la création d'une section : Libéria
    • GovCom a voté pour la présentation au Conseil d'administration pour approbation
    • Pas de questions/commentaires de la part du Conseil
  • VOTE : La section locale du Libéria devrait-elle être officiellement créée ?
    • Le Conseil a voté à l'unanimité en faveur de la création de la section locale
    • Le Secrétariat informera la section locale, entamera le processus administratif d'envoi de fonds et invitera à la réunion des meilleures pratiques pour démarrer une section locale

Réunion AMMNet 2025

  • Réunion des consortiums Grand Challenges, prévue les 9 et 10 juin au Mozambique, mais les manifestations locales et la sécurité et la proximité de l'Aïd al-Adha suscitent des inquiétudes
    • La réunion est toujours en cours, mais elle est surveillée, on ne sait pas si la confirmation du BMGF a été reçue
    • En raison de la situation sécuritaire qui règne actuellement au Mozambique et de la nécessité de disposer de suffisamment de temps pour planifier la réunion annuelle, nous planifierons la réunion dans un autre lieu
    • Envisagez d'échanger la réunion du MAMoD Africa (actuellement prévue du 11 au 13 juin)
      • Emilie vérifiera auprès d'eux (ce n'est pas essentiel à moins que le plan ne soit renvoyé au Mozambique)
  • Plan alternatif pour le lieu de l'assemblée annuelle (maintenant plan A)
    • Coordonner avec le GT sur les PME : ils n'ont pas encore choisi de date ni de lieu (mais ce sera en Afrique) et sont prêts à travailler autour d'AMMNet
        • Prioriser la planification d'une réunion au Sénégal pour s'aligner sur le GT sur les PME, entre juin et août
          • Jaline contactera les planificateurs de groupes de travail sur les PME avec une proposition
      • Si cette option nous intéresse, quelles sont nos préférences en matière de date et de lieu ? Jaline peut discuter avec les coprésidents du GT sur les PME
        • Les partenaires nationaux seraient plus susceptibles de participer, s'ils étaient axés sur les politiques
        • Nécessité de prendre en compte la fin de la subvention, 31 août 2025
        • Tenez compte de la capacité du pays d'accueil
        • Événement de groupe francophone
          • Envisagez d'organiser une réunion annuelle dans un pays francophone afin que nous puissions planifier simultanément l'événement ; l'événement francophone pourrait être intégré à l'événement annuel et le groupe francophone jouerait un rôle de premier plan au sein du groupe de travail chargé de la planification des réunions annuelles
        • D'autres idées ?
          • Dakar, c'est facile pour les visas.
            • Si vous êtes à Dakar, il n'est pas nécessaire d'organiser séparément un événement francophone AMMNet distinct, mais demandez-leur de tirer parti de celui-ci
          • Le Rwanda ? (mais ce n'est pas un francophone)
      • Planification de l'événement : nous n'avions pas encore reçu de confirmation écrite du soutien de la part de BMGF, il y a donc encore une certaine incertitude quant à ce qui sera soutenu ou non cette fois-ci
        • Jaline discutera avec Jenn lors de la réunion du 20 décembre

Grand événement : Nairobi, École panafricaine de formation sur la modélisation mathématique des maladies infectieuses (paludisme).

  • Cours de 2 semaines, été 2025 (dates à confirmer)
  • Le budget de l'AMMNet comprend les frais de voyage et d'hébergement pour la participation d'un membre du Conseil
  • Comment choisissons-nous les participants ? Loterie ?
    • Peut prendre en charge la présence d'un membre du conseil d'administration pendant quelques jours
    • Des volontaires ?
      • Pensez à quelqu'un qui est basé ou à proximité
      • Choisir au hasard ? Vous avez choisi ceux du continent ? (Les membres du conseil d'administration ne doivent assister qu'à un seul événement organisé par un lauréat)
    • Emilie participera au cours (elle n'aura pas besoin de soutien)
    • Pensez d'abord à ceux qui se présentent eux-mêmes ; sinon, faites un tirage au sort

Feedback sur la révision du questionnaire du DHS (ne demandant pas explicitement la participation de l'AMMNet, mais les commentaires de l'équipe)

  • le portail est ouvert du 13 janvier au 3 mars
  • voulons-nous organiser un ensemble d'entrées « en équipe » ? (préférence aux réponses individuelles)
  • également un certain intérêt à comprendre quels indicateurs sont utilisés
  • Ils préfèrent la contribution de l'équipe
  • Quels indicateurs sont utilisés pour des communautés spécifiques
  • La réponse collectée par AMMNet est préférable, placez-la dans un document cohérent
  • Le conseil d'administration est intéressé à le faire ? Ou un appel à manifestation d'intérêt au sein d'AMMnet ? Envisagez de créer un groupe de travail. Pour TF, faites appel à des volontaires.
  • Nous faciliterions la collecte de commentaires auprès d'AMMNet, puis nous/Conseil organiserions les réponses
  • Décision : intérêt modéré en tant qu'AMMNet ; ne priorisera pas, mais d'autres personnes peuvent recueillir les informations qu'ils souhaitent et les soumettre à l'équipe du DHS,
  • L'AMMnet partagera avec ses membres une fois le portail ouvert
    • Le secrétariat inclura dans le bulletin de janvier

Formation en matière de leadership pour les membres du Conseil

  • Envisagez d'explorer une formation à redonner à ceux qui consacrent beaucoup de temps à l'AMMNet en tant que membres du conseil d'administration
  • Y a-t-il des ressources de formation au leadership à nous recommander d'explorer ?
    • LinkedIn Learning, Hannah avait l'intention d'étudier de plus près
    • Skill Path, 600$, leadership et mentorat, etc. En personne et en ligne
  • Le Secrétariat étudiera et mettra à jour lors de la prochaine réunion
  • Les membres du Conseil continueront à explorer et à partager avec le Secrétariat

Développement de sites Web

  • En attente d'une proposition révisée de Defijn
  • Groupe de travail chargé d'examiner les principaux développements et de fournir des commentaires
    • Manuela
    • Ida
    • Des bénévoles au conseil d'administration ?
      • Hannah
    • Pourrait également contacter d'autres membres qui pourraient contribuer
    • Shannon enverra un formulaire Google aux membres pour la refonte du site Web d'AMMnet, nom, e-mail, pourquoi vous êtes intéressée
  • Points clés/prochaines étapes, au cours desquelles le TF sera invité à donner son avis
    • Atelier de stratégie visuelle pour un site Web (recherche d'une orientation quant à l'ambiance et à l'esthétique du site Web)
    • Idéation et validation du concept d'interface utilisateur (éléments visuels)
    • Terminer/finaliser l'interface utilisateur