Hackathon: Pipeline d'analyse de données biomédicales reproductible avec R et Quarto, en portugais

Quand

August 6, 2026

Heure

14-16hr UTC

Catégories

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Inscriptions clôturées
À propos de l'instructeur :

Arsénio Nhacolo, PhD est directeur de la gestion des données et de l'analyse statistique au Centre de recherche en santé de Manhiça (CISM) au Mozambique. Il est titulaire d'un doctorat en statistiques médicales de l'université de Brême (Allemagne), d'un master en biostatistique de l'université de Hasselt (Belgique) et d'une licence en mathématiques de l'université Eduardo Mondlane (Mozambique).

Il a une grande expérience en gestion des données, biostatistique, épidémiologie, science des données, apprentissage automatique, modélisation des maladies infectieuses, qualité des données d'essais cliniques et conformité réglementaire. Il a mené des améliorations significatives des systèmes de gestion des données du CISM, a contribué à la conception, à l’analyse et à la diffusion de nombreux projets de recherche biomédicale, et a participé à la formation de chercheurs en statistiques computationnelles, en science des données et en analyse avancée des données à l’université Eduardo Mondlane et à l’Institut africain des sciences mathématiques (AIMS) au Rwanda.

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Diapositives de présentation

Résumé du séminaire

AMMnet hosted its first Lusophone Hackathon, organized by AMMnet's Lusophone Leadership Team and led by Arsénio Nhacolo. The hands-on, interactive session introduced participants to the principles of reproducible biomedical data analysis using R and Quarto — two open-source tools that enable transparent, automated, and easily shareable analytical workflows.

Participants learned how to organize a complete data analysis pipeline, integrate code, statistical results, and narrative text into a single dynamic document, and produce professional, reproducible reports. The session also covered best practices in project organization, documentation, and reproducible research — skills increasingly valued across biomedical research and public health contexts, including surveillance data, clinical trials, and epidemiological studies.

The session was designed for participants with basic to intermediate R knowledge and was conducted in Portuguese, marking an important step in expanding AMMnet's hackathon programming to Lusophone communities.

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