Reunião anual de 2024

Discurso de abertura

Emilie Pothin, cofundadora da AMMNet e líder do grupo de análise e modelagem de intervenção na Swiss TPH, deu início à reunião da AMMNet de 2024 dando as boas-vindas a todos os participantes.

Ela expressou especial gratidão a Shannon, Gianpaolo e outros membros encarregados de organizar este evento de dois dias, bem como aos apresentadores, palestrantes, treinadores e outros colaboradores por seu envolvimento na reunião. Por fim, em nome da AMMNet, Emilie agradeceu especialmente à Fundação Bill e Melinda Gates por apoiar a Reunião AMMNet de 2024, bem como a todos os eventos organizados pela AMMNet. Prosseguindo, Emile destacou que o objetivo do AMMNet é conectar pessoas, compartilhar conhecimento e criar redes para o avanço da pesquisa sobre malária.

Jaline Gerardin, diretora executiva e presidente do conselho da AMMNet, acompanhou Emilie e começou parabenizando a AMMNet por seu segundo aniversário. Ela enfatizou o notável crescimento da AMMNet, que se expandiu para incluir mais de mil membros desde a sua criação. Em seguida, ela apresentou o Conselho Consultivo da AMMNet, junto com os 4 comitês e subgrupos.

Em relação às oportunidades de financiamento da AMMNet, Jaline disse que a AMMNet apoiou 18 eventos locais da AMMNet até agora, com 32 ainda restantes. Ela também anunciou uma nova oportunidade de financiamento de cerca de 40.000 dólares, para projetos de treinamento ou para eventos presenciais em um país endêmico de malária. Ela também lembrou a aprovação da nova política de capítulos locais em 2024.

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SESSÃO 1: Visão geral do tipo de modelos

Moderado por Hannah Slater
Nesta seção, Punan Amratia, Caitllin Bever e Shazia Ruybal-Pesantez nos deram uma ideia sobre os diferentes tipos de modelos.

Modelagem dinâmica (Caitlin Bever)

Caitlin começou sua apresentação fazendo algumas perguntas sobre modelagem, incluindo: o que é um modelo? Por que usamos modelos? O que é um modelo dinâmico? E o que é um modelo mecanicista?

De acordo com Caitlin, os modelos nos permitem testar ideias que seriam difíceis de explorar no mundo real, devido à complexidade, ética, impraticabilidade do tempo e medições que são difíceis de fazer. Em sua apresentação, Caitlin relembrou um exemplo de aplicação da modelagem dinâmica para tomar decisões reais, usando o exemplo da modelagem como um componente da alfaiataria subnacional na Nigéria. Ela terminou dizendo que modelos dinâmicos podem ser ferramentas poderosas para explorar diversas questões sobre como conduzir a luta contra a malária. No entanto, nenhum modelo que possa realmente refletir o futuro.

Modelagem geoespacial (Punam Amratia)

O apresentador começou citando Elliot & Waternburg 2004, que definiu epidemiologia espacial como a descrição da variação geográfica da doença com relação aos fatores de risco demográficos, ambientais, comportamentais, socioeconômicos, genéticos e infecciosos. Essa abordagem de modelagem vincula essencialmente os dados a localizações geográficas específicas. Respondendo à pergunta por que as saídas geoespaciais são úteis, Punan enfatizou que as saídas geoespaciais fornecem uma representação fácil de entender, capturando o padrão com espaço e tendências ao longo do tempo. Esses resultados são usados para apoiar a tomada de decisões baseada em evidências.

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• Modelagem genômica (Shazia Ruybal-Pesantez)

A apresentadora começou sua apresentação destacando que a geração de dados genômicos agora é mais barata e acessível devido ao sequenciamento de alto rendimento. Além disso, os dados genéticos complementam a vigilância da malária, fornecendo informações sobre epidemiologia e padrões de transmissão.

O apresentador também forneceu aplicações programáticas de epidemiologia genética, como detectar resistência a medicamentos, avaliar a intensidade de transmissão estimando R0, identificar casos importados, caracterizar cadeias de transmissão locais e validar métricas genéticas para estratégias de controle da malária.

Discussão em grupo
Perguntas abordadas:

• Que tipos de perguntas podem ser abordadas com esse tipo de modelagem?
• Quais são os desafios (de dados ou analíticos/técnicos) no desenvolvimento desse tipo de modelo?
• Quais são os pontos fortes desse tipo de modelo? Forneça um exemplo real desse modelo sendo aplicado à tomada de decisões.
• Quais são os desafios na comunicação dos resultados desse tipo de modelo?

Modelo dinâmico
Tipos de perguntas que podem ser abordadas usando modelagem:
Avaliar o impacto potencial de várias intervenções;

• Prever as tendências futuras da carga da malária;
• Desenvolvimento de medicamentos: As informações genômicas podem contribuir significativamente para o desenvolvimento de novos medicamentos.
• Determinar as estratégias ou combinações de estratégias mais eficazes para a eliminação, controle e eliminação da malária, incluindo alocação de recursos;
• Avalie estratégias para mitigar o impacto da resistência a medicamentos e inseticidas.

Desafios (dados/técnicos) no desenvolvimento desse tipo de modelo:

• Acessibilidade de dados;
• Dados de alta qualidade;

Pontos fortes desse tipo de modelo:

• Previsão de tendências futuras;
• Fornece uma plataforma para avaliar o impacto potencial de diferentes estratégias de intervenção

Exemplos reais desse modelo sendo aplicado à tomada de decisões:

• Apoiar o Plano Estratégico da Malária dos países (Nigéria, Tanzânia e Moçambique);
• Moldar estratégias de longo prazo, como o GTS 2016-2030;

Desafios na comunicação dos resultados desse tipo de modelo:

• Use a linguagem e as visualizações corretas para comunicar efetivamente os resultados a diferentes públicos;
• Apresentar os resultados em um formato relevante e acionável para diferentes tomadores de decisão;

Relatório sobre a Breakout Session (Genomic, liderada por Monica Golumbeanu e Shazia Ruybal-Pesantez)

Pontos de discussão:

Resultados esperados da pesquisa genômica:

• Compreendendo as origens das doenças: Os participantes enfatizaram a importância da pesquisa genômica na identificação das origens das doenças, especialmente em países com fronteiras porosas.
• Compreender os genes de vetores e parasitas latentes pode ajudar nos esforços de vigilância, apesar dos desafios.
• Desenvolvimento de medicamentos: As informações genômicas podem contribuir significativamente para o desenvolvimento de novos medicamentos.
• Farmacogenética: Esse campo é crucial para entender como diferentes faixas etárias respondem aos medicamentos, o que é essencial para a medicina personalizada.
• Bioinformática genômica: Esta área pode fornecer informações sobre a base genética da doença e ajudar no desenvolvimento de terapias direcionadas.
• Resistência a inseticidas e medicamentos: Compreender a base genética da resistência em vetores e medicamentos é crucial para o desenvolvimento de estratégias de controle eficazes.

Fontes de dados genômicos:

• PCR e QPCR: Essas técnicas são comumente usadas para análise genética.
• Dados de DNA e RNA: Ambos os tipos de dados são valiosos para a pesquisa genômica.
• Sequenciamento molecular: Este método é essencial para obter informações genéticas detalhadas.
• Outros comentários: Os participantes discutiram a importância da disponibilidade e do acesso aos dados, a relevância dos dados coletados ao longo do tempo e a necessidade de estudos longitudinais para entender os padrões.

Coleta de dados e relevância:

• Duração da coleta de dados: Os participantes concordaram que os dados devem ser coletados por um período suficiente para garantir sua relevância para a pesquisa.
• Coleta simultânea de dados genômicos e epidemiológicos: Houve um consenso sobre a importância de coletar os dois tipos de dados simultaneamente para fornecer uma compreensão abrangente dos padrões da doença.

Perguntas potenciais para modeladores:

• Modelos compartimentais: esses modelos podem ajudar a entender as informações genômicas.
• Locais de coleta de dados: Usar modelos para determinar onde dados genômicos específicos podem ser coletados é uma área potencial de pesquisa.
• Saídas geoespaciais: elas podem fornecer informações sobre onde certas informações são relevantes, auxiliando nos esforços de pesquisa direcionados.

Conclusão:A sessão de discussão sobre pesquisa genômica destacou o potencial dos dados genômicos na compreensão das origens das doenças, desenvolvimento de medicamentos e mecanismos de resistência. Os participantes enfatizaram a importância da disponibilidade de dados, a relevância dos estudos longitudinais e a necessidade de coleta simultânea de dados genômicos e epidemiológicos. A sessão também identificou possíveis questões de pesquisa para modeladores, com foco no uso de modelos para orientar a coleta e análise de dados.

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Sessão científica 1

Em uma sessão moderada por Benedicta Mensah, a seção científica contou com apresentações de Charlène Mfangnia, Lydia Braunak-Mayer, Olasapu Isaac, Kaba Lancei, Eric Ali e Hillary Topazin, que compartilharam suas descobertas de pesquisa.

Charlène Naomi Texto Mfangnia
País: Quênia
Instituição: Centro Internacional de Fisiologia e Ecologia de Insetos (Icipe)
Tópico: Uma ferramenta de dinâmica de sistemas para avaliar a eficácia da liberação de mosquitos infectados com MB na luta contra a malária

O palestrante explicou brevemente o mecanismo de transmissão do Plasmodium e a estratégia de controlar a malária modificando a população vetorial. O método utilizado foi o pensamento sistêmico e sistemas dinâmicos, por meio de calibração de dados e análise realizada. Eles observaram uma diminuição na incidência e no número de mortes. Ele concluiu indicando que é necessário indicar uma estratégia ideal com uma relação custo-benefício. As limitações do estudo foram a disponibilidade de um grande número de dados.

Olasupu Isaac
País: Nigéria
Instituição: Universidade Federal, Oye-Ekiti
Tópico: Modelando o efeito do padrão heterogêneo de picada do mosquito na intervenção de controle vetorial para a malária por Plasmodium falciparum na Nigéria

O estudo teve como objetivo avaliar o impacto dos padrões de picada de mosquito na eficácia dos LLINs na Nigéria. Os resultados da pesquisa indicam que, embora aumentar a cobertura de LLINs possa reduzir a incidência de malária, combinar isso com esforços para reduzir as taxas de picadas de mosquitos ao ar livre pode ser mais eficaz, especialmente em áreas com mosquitos que picam mosquitos ao ar livre significativos, como a gestão ambiental, para aumentar o sucesso dos LLINs nos esforços de controle da malária.

Lancey Kaba
País: mali
Instituição: Instituto Superior de Ciências e Medicina Veterinária de Dalaba
Tópico: Modelando o impacto da expansão da quimioprevenção sazonal da malária na Guiné: expansões demográficas e geográficas

Após a apresentação do contexto da malária na Guiné, ele procurou responder à pergunta feita pelo NMCP sobre a escolha entre a extensão demográfica e a extensão geográfica do SMC na Guiné. Usando o modelo EMOD para calibração e simulação de dados, os resultados mostraram que a extensão geográfica seria melhor. No entanto, o apresentador mencionou que concluiria o estudo com uma avaliação de custo-efetividade para uma decisão final, que será a próxima etapa de seu estudo.

Eric Ibrahim
País: Quênia
Instituição: Universidade de Kwazulu Natal e ICIPE
Tópico: Dinâmica espaço-temporal das sobreposições de nichos vetoriais da malária na África

Usando modelos de autômatos celulares, o objetivo do estudo é examinar a expansão das sobreposições de nicho entre os vetores primários e secundários da malária na África. O estudo revelou que a coexistência desses vetores afeta significativamente a transmissão da malária, enfatizando a importância das estratégias de controle interno e da bionomia. O apresentador destacou que a expansão das sobreposições de nichos coloca várias áreas em risco de transmissão sustentada e prolongada da malária e levanta preocupações sobre a possível propagação da malária se reintroduzida nas zonas atualmente livres de malária.

Hilary Topazin
País: Reino Unido
Instituição: Imperial College de Londres
Tópico: O uso de postos de vigilância, teste e tratamento para reduzir a malária nas regiões fronteiriças da África Subsaariana

Usou um modelo matemático de metapopulação de P. falciparum baseado em indivíduos para estimar a eficácia dos postos de fronteira no total de casos de malária endêmica subsaariana. O estudo se concentrou nas estratégias de eliminação da malária nos postos de fronteira, mostrando que as intervenções nesses postos evitaram casos e reduziram o PfPr2-10, especialmente em ambientes de baixa transmissão. O apresentador enfatizou que os postos de fronteira não permitirão que um país alcance a eliminação isoladamente e a necessidade de um esforço coordenado, já que apenas uma pequena proporção de indivíduos está se misturando em cada unidade de tempo.

Lídia Braunak-Mayer
País: Suíça
Instituição: TPH suíço
Tópico: Definindo critérios de perfil de produto alvo para vacinas contra malária de próxima geração para acelerar os esforços de eliminação: um estudo de modelagem

Usando uma estrutura de modelagem de epidemiologia e controle da malária (OpenMalaria), o estudo se concentra em acelerar o desenvolvimento de vacinas contra a malária de próxima geração, explorando as propriedades do produto necessárias para diferentes cenários de implantação com o objetivo final de eliminar a malária. O apresentador destacou a importância da alta cobertura de intervenção e das propriedades rigorosas da vacina em ambientes com PfPR2-10> 10% para alcançar um impacto substancial e acelerar a eliminação. O apresentador enfatizou a necessidade de abordagens com vários alvos e os benefícios da implantação de vacinas específicas com base no nível de prevalência inicial. O apresentador também ressalta a importância das vacinas imunogênicas e protetoras para todas as faixas etárias, especialmente em ambientes com baixa prevalência inicial, para interromper a transmissão de forma eficaz.

Dia 2

No dia 2 da reunião da AMMNet Kigali, Benedicta Mensah, nos deu uma breve recapitulação do que aconteceu no dia 1. Ela foi seguida por Isambi Mbalawata, a MC do dia, que recebeu os participantes.
O discurso de boas-vindas de Isambi foi seguido pelo lançamento do Programa de Mentoria da AMMNet, por Luc Djogbenou e Vusi Magagula, do Comitê de Desenvolvimento de Carreira da AMMNet.

A apresentação do Comitê de Desenvolvimento de Carreira da AMMNet foi seguida pela sessão de treinamento,
Posteriormente, os participantes se dividiram em grupos após o painel de discussão em que Guiné, Etiópia e Benin deram uma visão geral do trabalho que cada país fez no que diz respeito à erradicação da malária.
Calibração e validação de modelos usando aplicação de inferência estatística bayesiana para modelos de malária (liderada por Rabiu Musa)

A sessão começou com uma introdução à calibração, validação e ilustração do modelo. Rabiu Musa forneceu uma visão geral abrangente da estimativa de parâmetros, destacando duas abordagens principais:

• Métodos de mínimos quadrados: Essa abordagem carece de propriedades estatísticas prováveis, o que a torna um método menos confiável para estimativa de parâmetros.
• Estimativa de máxima verossimilhança: ao contrário dos métodos de mínimos quadrados, a estimativa de máxima verossimilhança tem propriedades estatísticas comprováveis, tornando-a um método mais confiável para estimativa de parâmetros.

Rabiu ainda se aprofundou em dois tipos de estimativa de máxima verossimilhança:

• Bootstrapping: Uma técnica de reamostragem que envolve gerar um grande número de reamostras do conjunto de dados original e usar essas reamostras para estimar a distribuição do estimador.
• Inferência Bayesiana: Um método que combina conhecimento prévio com dados observados para atualizar a probabilidade de hipóteses. É conhecido por ser computacionalmente intensivo.

Após a introdução teórica, os participantes ganharam experiência prática com a estimativa bayesiana. Rabiu conduziu uma sessão prática usando o pacote “STAN” em linguagem R para estimar o surto de influenza na Grã-Bretanha em 1978. Essa aplicação prática demonstrou a aplicação da inferência estatística bayesiana em cenários do mundo real, fornecendo aos participantes informações valiosas sobre o processo de calibração e validação do modelo.

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Sessão 2:

A sessão científica do segundo dia foi baseada no Fortalecimento da Capacidade de Modelagem da Malária na África Subsaariana, com apresentações de estagiários do BMGF Grands Awardees Consortia

Padrões espaço-temporais de transmissão da malária entre crianças de 6 a 59 meses em Gana; aplicação de modelos hierárquicos bayesianos

Sabedoria Kwami Takramah,WAMCAD

Em sua apresentação, Wisdom descreveu pela primeira vez o problema da malária em crianças. Cerca de um quarto (25%) das 20.000 mortes anuais por malária em Gana são causadas por crianças menores de 5 anos. Para a pesquisa, ele extraiu dados de malária da Pesquisa Demográfica e de Saúde de Gana, bem como da Pesquisa de Indicadores de Malária de Gana. Ele usou variáveis climáticas, variáveis populacionais e cobertura de ITN para determinar o número de crianças menores de 5 anos com teste de diagnóstico rápido positivo para malária. Wisdom então estimou um mapa geoespacial do agrupamento do risco relativo de malária entre as crianças. Os clusters foram determinados com valores alto-alto, baixo-baixo, alto-baixo e baixo-alto de risco relativo de malária. Ele então desenvolveu um modelo espaço-temporal hierárquico bayesiano para prever o risco de malária. Isso permitiu que ele identificasse o alto e baixo risco relativo suave de malária entre crianças menores de 5 anos nas diferentes regiões de Gana. A partir dos hotspots, intervenções públicas podem ser implantadas e, a partir dos pontos frios, lições podem ser aprendidas.

Modelagem da prevalência e dinâmica da carga de malária no estado de Bauchi, Nigéria: usando SIRH_sim — Modelo compartimental

Dra. Amusaidu Saleh,Nigéria MMF

O Dr. Saleh, em sua apresentação, começou com um mapa mostrando a distribuição do risco da malária nos estados e zonas da Nigéria. Ele então falou sobre o estado de Bauchi, que tem uma alta prevalência de malária. Em sua pesquisa, ele usou um modelo compartimental suscetível-infeccioso-recuperado para ajudar a prever a prevalência e compreender a dinâmica da transmissão da malária no estado de Bauchi para uma melhor tomada de decisão. Ele usou 2 anos de dados de incidência de malária do sistema distrital de informações de saúde 2 para construir o modelo para simular a transmissão no estado de Bauchi. Ele relatou que o modelo estimou a prevalência da malária no estado de Bauchi em 3,19%, o que sugere que as intervenções existentes são eficazes. Outras descobertas foram que há uma alta taxa de transmissão de humanos suscetíveis a infectados; baixa taxa de recuperação da malária; transmissão moderada de humano infectado para mosquito suscetível e alta taxa de transmissão de mosquitos infecciosos para humanos suscetíveis.

Modelagem geoespacial para melhorar a vigilância de campo de Anopheles Gambiae s.i por meio de um projeto de amostragem espacial adaptativo

Gabriel Michel Monteiro, Mamoda África

Gabriel, em sua apresentação, começou destacando a importância da vigilância de campo dos vetores da malária. Ele disse que monitora populações e dinâmicas de vetores da malária, taxas de picadas, resistência a inseticidas e comportamentos de repouso. Isso ajuda no direcionamento de intervenções, bem como no monitoramento de estratégias para o controle da malária. Ele então definiu o desenho de amostragem adaptativo e explicou que ele é preferido porque é guiado por um alvo preditivo e forneceu evidências de design adaptativo para controle ou vigilância de doenças na forma de publicações. Ele então falou sobre o objetivo do estudo de avaliar a eficácia dos projetos de amostragem adaptativa espacial para vigilância vetorial em termos da redução da incerteza do modelo e do aumento na precisão da descrição dos padrões espaciais dos mosquitos. A coleta entomológica foi feita em 2018 (fase 1) e 2021 (fase 2) no Benin. Gabriel então detalhou as etapas em seu projeto adaptativo antes de descrever as capturas de vetores da malária por fase de amostragem (2018 e). Ele apresentou que a estrutura geral permitiu mais capturas de vetores da malária, o desempenho do modelo melhorou, mas o erro de estimativa não melhorou devido ao alvo adaptativo. Ele descobriu que havia um risco aumentado de Anopheles Gambiae na maioria das regiões. Em conclusão, ele falou sobre as vantagens de usar o design espacial adaptativo.

Investigando uma abordagem regional coordenada para a eliminação da malária usando modelagem matemática

Hilja Eelu, MMALA

Em sua apresentação, Hilja começou mostrando um mapa da intensidade da transmissão da malária no sul da África. Em seguida, ela falou sobre iniciativas de vários países contra a malária na área. Em seguida, ela descreveu e comparou populações em risco, casos, mortes, cobertura do ITN e do IRS e financiamento da malária na situação em Angola, Namíbia e Zâmbia. Ela então descreveu o modelo de metapopulação de acoplamento cruzado para as três áreas de Angola, Namíbia e Zâmbia e ilustrou o modelo para cada mancha. Este modelo será usado para determinar a influência da infecciosidade das manchas vizinhas. Em seguida, ela descreveu o treinamento que recebeu do Centro de Modelagem e Simulação da África (MASHA) e de organizações como a Elimination 8 (E8) e o Centro Nacional de Controle de Doenças Transmitidas por Vetores da Namíbia, que foram fundamentais em seu estudo.

Propagação da resistência a inseticidas em uma população de vetores da malária: uma abordagem de modelagem matemática

Sylvere Kezeta, Um Comvec

Sylvere começou descrevendo a carga da malária no mundo. Ele então falou sobre as medidas de controle vetorial dos ITNs e do IRS e explicou que a expansão dos ITNs contribuiu para a redução da carga da malária em 2005-2015. Ele ainda disse que a desaceleração na redução da malária se deve à redução de inseticidas. Seu principal objetivo era usar a modelagem matemática para entender como surge a resistência a inseticidas. Seus objetivos específicos são construir e analisar um sistema dinâmico, identificar os principais fatores e depois propor estratégias. Em seguida, ele explicou uma ilustração de um fluxograma de seu modelo e das suposições. Sylvere acredita que suas descobertas mostraram que o modelo está bem posicionado ao provar a existência de uma solução única, positiva e limitada. A próxima etapa do estudo é fazer uma análise matemática do modelo, simular e calibrar o modelo e, em seguida, gerar diferentes cenários.

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Hackathon AMMnet

Justin Miller, Christian Selinger

A dupla começou sua apresentação explicando o problema de participar de conferências focadas em melhorar as habilidades de codificação, mas não consegue se concentrar em manter e desenvolver as habilidades quando voltamos para casa. O objetivo do hackathon é fornecer suporte para aprender a codificar e como melhorar as habilidades de codificação remotamente, especificamente no tratamento, apresentação e análise de dados; design experimental, compreensão quantitativa, codificação e resolução de problemas e modelagem de transmissão. A ideia é que pessoas qualificadas se inscrevam e forneçam suporte e que os participantes enviem problemas relacionados à codificação para consideração. Dois ou três problemas são selecionados e discutidos por uma pequena equipe de especialistas que também prepara soluções. A solução é então apresentada em uma sessão de 2 horas com códigos gerados e armazenados. Eles encerraram a apresentação convidando as pessoas a se inscreverem como especialistas ou apresentarem problemas.

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AMMNet como parte da estratégia BMGF

Jennifer Gardy
Em seus comentários, ela disse que, no passado, os modeladores não eram representativos das comunidades que estavam sendo ajudadas, mas as coisas estão mudando. Ela parabenizou o crescimento da AMMNet, incluindo amigos de modeladores. Ela disse que a modelagem se encaixa na estratégia global de saúde da BMGF. A estratégia orienta a preparação para pandemias, malária e TB/HIV e analisa metas e objetivos ao longo de alguns anos e as formas de alcançá-los. O objetivo dessa estratégia é eliminar a malária durante nossa vida, mas existem alguns desafios. A primeira é que, entre 2005 e 2015, a incidência de malária caiu, mas desde então se estabilizou. A segunda é que o financiamento dos doadores diminuiu e o mundo precisa de três vezes mais financiamento do que temos atualmente. Por fim, o mundo precisa se manter à frente da evolução do vetor para evitar resistência. Isso pode ser conseguido com novos medicamentos e vacinas. Ela ainda disse que a modelagem pode ser útil na definição da estratégia de saúde pública, ajudando na adaptação subnacional das intervenções contra a malária, uma vez que a cobertura geral não está ajudando. Ela concluiu dizendo que a modelagem é uma ferramenta fundamental no trabalho que está acontecendo na fundação Gates.

Comentários de encerramento
O discurso de encerramento foi feito por Jaline Gerardin e encerrou a reunião agradecendo a toda a equipe de gerenciamento e membros da AMMNet, mas também aos financiadores, como a Fundação Bill e Melinda Gates, por seu apoio financeiro que permitiu a organização do evento e aguardaram ansiosamente a próxima reunião da AMMNet em 2025.